JavaScript有许多严重先天缺陷，毕竟它当时被设计也没花多久，这门语言好像是花了10天设计的？我觉得JavaScript必然会被替代。
当然我说的替代不是浏览器这个沙箱里以后不再跑JavaScript，而是由其他语言来写，然后再转换为JavaScript——例如FunScript（用F#写完转换成JavaScript）、CoffeeScript等等。
JavaScript成为类似汇编语言一样的东西，只有搞编译（或者应该叫转译吧）器的人才去写JavaScript，用JavaScript直接写Web应用的人越来越少。
那么jQuery就是这个演化过程中的必然，以后写JavaScript的肯定越来越少，把jQuery视为这个过程中的一门新的语言我觉得也不是不可以。
至于你说的什么大量的低质量插件扩展、大量的低质量程序员等等这是所有热门语言或者框架的普遍现象，程序员不按编程规范来写并不是jQuery本身的黑点，个人还是看好jQuery的前景的。
所以现在一直在鼓吹原生JavaScript的，在我看来就像一直在鼓吹汇编万能的人一样。汇编性能在正确使用的情况下最强没有之一是事实，但是并不是什么都需要性能特别是性能需求不高的客户端应用。所以业务使用中，如果没有特别的性能需求，哪个开发起来快用哪个（反正是在客户端跑嘛，服务器端就不能这么随便）。
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